Vystudoval hru na violoncello na Konzervatoři v Pardubicích u Josefa Krečmera a HAMU v Praze u prof. Miroslava Petráše. Celé studium potom završil studiem na Hochshule für Musik ve švýcarském Luzernu u Marka Jerie.

Již od studií se prezentuje jako sólista. Vystoupil např. s Filharmonií Hradec Králové, Komorní filharmonií Pardubice, Severočeskou filharmonií Teplice, Karlovarským symfonickým orchestrem, Západočeským symfonickým orchestrem Mariánské lázně.

Vedle sólistické dráhy se věnuje komorní hudbě, a to zejména v Kalliopé trio Prague a Barocco Sempre Giovanne, kde je zakládajícím členem a pravidelným sólistou.

Hlavním těžištěm jeho činnosti je ovšem činnost pedagogická a hudebně osvětová. Věnuje se dlouhodobě mladým muzikantům na základním stupni školství. Od roku 2013 je pedagogem na Konzervatoři Pardubice.

Zajímavou kapitolou je činnost hudebně propagátorská a do té se bezesporu vejde netradiční soubor čtyř violoncellistů Cello Republic, jehož je členem.

Jan Zemen hraje na nástroj Karel Joseph Dvořák 1946.